Alle opleidingen kunnen ook deeltijds worden gevolgd (op half tempo). Daarnaast biedt de ETF sinds 2009 via afstandsonderwijs ("blended learning") een deeltijd variant aan van de masteropleiding (afstudeerrichting Kerk en Pastoraat). De naam hiervan is ETF Open University. Er is ook voorzien in een pre-master voor studenten met een professionele theologische bachelor (HBO GPW) of een academisch diploma in een andere discipline (bachelor of master).